Нужно ли удерживать НДФЛ с компенсации стоимости билета, который командированный приобрел за бонусы?
Если ваш работник приобрел билет за мили (баллы, бонусы), значит, он ему достался бесплатно. Но далеко не каждая компания-перевозчик делает в своих билетах пометку о способе оплаты. При покупке, например, билетов РЖД за бонусы некоторых банков на билете указывается, что он оплачен наличными. Поэтому все будет зависеть от того, что написано в билете.
СИТУАЦИЯ 1. В билете указана его полная стоимость и не указано, каким образом он оплачен. Тогда нужно, как обычно, возместить "расходы" на проезд сотруднику, а НДС по нему можно будет принять к вычету. Получается, что работник таким вот нестандартным способом может обналичить свои накопленные бонусы от перевозчика.
СИТУАЦИЯ 2. В билете указано, что он частично оплачен бонусами, частично - деньгами. То есть из билета видно, сколько "живых" денег потратил работник. Допустим, в соответствии с программой перевозчика пассажир оплачивает деньгами только топливный сбор. Тогда нужно возместить сотруднику только его реальные расходы.
СОВЕТУЕМ РАБОТНИКУ
Лучше не оплачивать билеты в командировку личными накопленными бонусами или милями. Если в билете будет указано, что он был оплачен бонусами, или в нем вообще не будет указана цена, организация не возместит стоимость билета.
Если же руководство несмотря ни на что примет решение компенсировать полную стоимость билета, то с части стоимости билета, оплаченной бонусами, безопаснее удержать НДФЛ, начислить страховые взносы и не учитывать это возмещение в "прибыльных" расходах.